Jepang, negara dengan tingkat kemunculan kaiju tertinggi di dunia. Tiada hari bagi negara itu tanpa berhadapan dengan kaiju. Kafka Hibino dulu bercita-cita menjadi anggota pasukan pertahanan, namun kini dia harus puas dengan pekerjannya sebagai pembersih kaiju. Suatu hari sesosok makhluk misterius mengubah tubuhnya menjadi kaiju. Sejak itulah dia disebut “Kaiju no.8” oleh pasukan pertahanan Jepang yang bertugas membasmi kaiju.