“Umat manusia akan punah pada tahun 2017.”
Hal itu dibuktikan oleh hilangnya sebuah cahaya kehidupan pada masa depan yang diawasi “Chaldea”, organisasi penjamin kelangsungan hidup umat manusia. Untuk mencegah agar hal itu tidak terjadi, "Chaldea" mengirimkan anggotanya ke kota Fuyuki, Jepang, pada tahun 2004, tempat yang diduga sebagai penyebab kepunahan umat manusia... Apakah yang menanti mereka disana!?